Cell | 染色质激活或抑制状态不得不了核小体分离的差异性

2021-10-13 14:08:20 来源:
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线粒体内部结构通过作出贡献或消除该内部结构的核糖体可以控制性状组的系统和细胞身份确认。这些线粒体内部结构中的存在特定的甲基化翻译后;也(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定核糖体状态相关,并可作出贡献消除性DNA内部结构的形成,影响性状的表达出来。为了在生殖细胞时过去依然性状表达出来程序的延续性,决定线粒体内部结构的分子特性也需在子代细胞中的成立。成立不同多种类同型线粒体状态的重要密切相关是甲基化PTMs,主要存在于甲基化H3和H4的前肢上。因此,在生殖细胞的过程中的,除了DNA解码,杂交核小体也需重建,并均等到子代细胞中的。确实,科学研究挖掘出杂交的经典甲基化(比如解码依赖于的甲基化)会在解码叉后快速重新制造。不同的科学研究组挖掘出H3K9me3和H3K27me2/3可通过线粒体基因。然而,这两个甲基化;也都是与消除性线粒体内部结构相关。那么,杂交中的的核小体,以及它们可携带的甲基化PTMs是否都能基因到子代细胞并不相同的性状正中的央上呢?来自纽约大学兰戈恩医学中的心的Danny Reinberg客座教授课题组在Cell发表科学研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该科学研究挖掘出在DNA解码时,核糖体与受消除线粒体范围的核小体分离是不同的。受消除线粒体内部结构中的的核小体会被就近在子代细胞并不相同的性状范围,而核糖体同型线粒体内部结构中的的核小体的均等则是低质量和随机的。为科学研究核小体的分离情形,科学实证在候选性状正中的央暂时性上标甲基化H3.1和H3.2,以锁定活体生殖生殖细胞中的核小体在生殖细胞时的变化。简单来说,该方法通过邻近蛋白上标技术,利用CRISPR为特定性状正中的央的H3.1和H3.2带上丝氨酸上标,经ChIP-qPCR检测该丝氨酸上标在线粒体G1期和S期的同位素,以中间体核小体的分离情形。若该肽链H3.1和H3.2上的丝氨酸上标在一次生殖细胞后下降一半,说明了该核小体被就近在了两个子代细胞的并不相同性状正中的央上;若该丝氨酸;也不久消失,说明了子代细胞未基因该性状正中的央的核小体。科学实证首先检测了在生殖生殖细胞中的沉默表达出来的Hoxc6, Ebf1, Meis2性状的核小体分离情形。这些性状正中的央的核小体丝氨酸程度随生殖细胞逐渐减为,这提示受消除的性状正中的央的核小体会被就近在子代细胞的并不相同位置。这与前人挖掘出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过线粒体基因的现象相印证。那么,核糖体同型线粒体范围的核小体又是如何分离的呢?科学实证检测了在生殖生殖细胞中的被核糖体表达出来的Ccna2, Nanog和Pou5f1性状,挖掘出该性状正中的央的丝氨酸上标在生殖细胞后长方形低质量状态,同位素高得多,这提示对于核糖体同型线粒体范围来说,杂交核小体没有正确地的均等到子代细胞也就是说的性状正中的央,而是随机均等的。更为有意思的是,在抑制生殖生殖细胞分化时,Hoxc6性状由消除转为核糖体,它的核小体均等模式也由正确地的同肽链均等改成随机均等。这说明了杂交核小体的局部均等,可以反映该线粒体范围的活性状态。总的来说,该科学研究通过CRISPR便是的甲基化丝氨酸上标控制系统,科学研究了核小体在生殖细胞过程中的的均等模式,并挖掘出核糖体与受消除的线粒体范围的核小体均等模式的不同。都有的是,在线粒体的S近十年的,受消除的线粒体范围的解码要晚于核糖体同型线粒体范围。这个时间相异也造成了常线粒体的解码中间体速度快相等异线粒体。异线粒体相对较慢的解码速度快可能必要了核小体的正确地均等,而常线粒体中的的PTMs则由也就是说的主抑制因子(master regulators)直接识别也就是说DNA序列,并动员PTMs酵素重新成立。原始说是:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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